Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ITGA10O75578 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms