Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NIPSNAP2O75323 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms