Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKNO60260 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKNO60260 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKNO60260 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKNO60260 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKNO60260 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKNO60260 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKNO60260 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKNO60260 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKNO60260 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRKNO60260 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKNO60260 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKNO60260 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms