Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCO2O43819 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCO2O43819 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCO2O43819 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCO2O43819 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCO2O43819 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCO2O43819 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCO2O43819 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCO2O43819 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCO2O43819 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCO2O43819 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCO2O43819 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCO2O43819 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCO2O43819 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCO2O43819 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCO2O43819 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCO2O43819 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCO2O43819 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCO2O43819 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCO2O43819 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms