Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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KCNQ3O43525 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNQ3O43525 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNQ3O43525 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNQ3O43525 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNQ3O43525 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNQ3O43525 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNQ3O43525 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNQ3O43525 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNQ3O43525 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNQ3O43525 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNQ3O43525 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNQ3O43525 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNQ3O43525 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNQ3O43525 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNQ3O43525 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNQ3O43525 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNQ3O43525 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNQ3O43525 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
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