Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTSS1O43312 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTSS1O43312 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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