Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLOCKO15516 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms