Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNMO15061 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNMO15061 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNMO15061 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNMO15061 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNMO15061 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNMO15061 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNMO15061 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNMO15061 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNMO15061 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNMO15061 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNMO15061 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNMO15061 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNMO15061 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNMO15061 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNMO15061 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNMO15061 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNMO15061 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNMO15061 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNMO15061 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNMO15061 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNMO15061 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNMO15061 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNMO15061 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNMO15061 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNMO15061 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNMO15061 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNMO15061 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNMO15061 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNMO15061 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNMO15061 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNMO15061 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms