Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms