Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
USP17L13C9JLJ4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP17L13C9JLJ4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms