Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms