Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DGG1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DGG1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DGG1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DGG1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DGG1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DGG1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DGG1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DGG1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DGG1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DGG1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DGG1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DGG1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DGG1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
B4DGG1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
B4DGG1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
B4DGG1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
B4DGG1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms