Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF25A6NGN4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PRAMEF25A6NGN4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PRAMEF25A6NGN4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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