Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HMX2A2RU54 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms