Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms