Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TUBE1Q9UJT0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms