Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFMBT1Q9UHJ3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms