Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
REREQ9P2R6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms