Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CCDC180Q9P1Z9 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC180Q9P1Z9 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms