Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SCHIP1Q9P0W5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms