Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAPAQ9P0L0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms