Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD3AQ9NVI7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms