Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG3Q9NT62 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms