Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF275Q9NSD4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF275Q9NSD4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF275Q9NSD4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF275Q9NSD4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF275Q9NSD4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF275Q9NSD4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ZNF275Q9NSD4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF275Q9NSD4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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