Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTPS2Q9NRF8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTPS2Q9NRF8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms