Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GOPCQ9HD26 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GOPCQ9HD26 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GOPCQ9HD26 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GOPCQ9HD26 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GOPCQ9HD26 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GOPCQ9HD26 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GOPCQ9HD26 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GOPCQ9HD26 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GOPCQ9HD26 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GOPCQ9HD26 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GOPCQ9HD26 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GOPCQ9HD26 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GOPCQ9HD26 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GOPCQ9HD26 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GOPCQ9HD26 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GOPCQ9HD26 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GOPCQ9HD26 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GOPCQ9HD26 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms