Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
POLR2J2Q9GZM3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POLR2J2Q9GZM3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms