Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM8Q9BZR9 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM8Q9BZR9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms