Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM3Q9BZL3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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