Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCGF6Q9BYE7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCGF6Q9BYE7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms