Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KDM5DQ9BY66 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5DQ9BY66 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms