Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SRRTQ9BXP5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRRTQ9BXP5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms