Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VN1R3Q9BXE9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms