Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KATNB1Q9BVA0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KATNB1Q9BVA0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms