Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBB6Q9BUF5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms