Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARXQ96QS3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
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