Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
JSRP1Q96MG2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms