Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNX27Q96L92 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms