Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRIQ1Q96JM4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms