Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCARF2Q96GP6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms