Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RPUSD4Q96CM3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RPUSD4Q96CM3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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