Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BHMTQ93088 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms