Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN4Q92575 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms