Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CTTNBP2Q8WZ74 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTTNBP2Q8WZ74 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms