Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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C11orf40Q8WZ69 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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C11orf40Q8WZ69 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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C11orf40Q8WZ69 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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C11orf40Q8WZ69 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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C11orf40Q8WZ69 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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C11orf40Q8WZ69 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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C11orf40Q8WZ69 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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C11orf40Q8WZ69 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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C11orf40Q8WZ69 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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C11orf40Q8WZ69 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C11orf40Q8WZ69 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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