Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPBAR1Q8TDU6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms