Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNERQ8NFT8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms