Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF397Q8NF99 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms