Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LINC00612Q8N6U2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms