Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms